gcc -pthread -fno-strict-aliasing -g -O2 -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -fPIC -I/home/vagrant/python/include/python2.7 -c external /KentLib/wWigIO/wWigIO.c -o построить/temp.linux-i686-2.7/внешний/KentLib/wWigIO/wWigIO.o -w -shared -fPIC -p -Iexternal/KentLib/вклПочему GCC не ссылается на libz?
Тогда :
GCC -pthread -shared сборки/temp.linux-i686-2.7/внешний/KentLib/wWigIO/wWigIO.o -o построить/lib.linux-i686-2.7/wWigIO.so -DMACHTYPE_x86_64 - lz -lm внешний/KentLib/lib/jkweb.a
(извините за грязного Несс этих команд, которые я хотел, чтобы скопировать их дословно, чтобы не оставлять важные детали)
Затем я смотрю на символы, и обратите внимание, что compress
не определен:
Это не кажется
$ nm build/lib.linux-i686-2.7/wWigIO.so | grep compress
U compress
0002486d t getDecompressor
00024b28 T lineFileDecompress
00024c0f T lineFileDecompressFd
00024c8b T lineFileDecompressMem
U uncompress
00037cd2 T zUncompress
быть ссылки на любой
libm
или
libz
:
$ ldd build/lib.linux-i686-2.7/wWigIO.so
linux-gate.so.1 => (0xb76e2000)
libpthread.so.0 => /lib/i386-linux-gnu/libpthread.so.0 (0xb7668000)
libc.so.6 => /lib/i386-linux-gnu/libc.so.6 (0xb74be000)
/lib/ld-linux.so.2 (0xb76e3000)
Я знаю, что установлен libz и это в пути поиска:
$ sudo cat /etc/ld.so.conf
include /etc/ld.so.conf.d/*.conf
$ sudo cat /etc/ld.so.conf.d/*.conf
# Multiarch support
/lib/i386-linux-gnu
/usr/lib/i386-linux-gnu
/lib/i686-linux-gnu
/usr/lib/i686-linux-gnu
# libc default configuration
/usr/local/lib
libz находится в этих местах:
$ locate libz
/lib/i386-linux-gnu/libz.so.1
/lib/i386-linux-gnu/libz.so.1.2.3.4
/usr/lib/i386-linux-gnu/libz.a
/usr/lib/i386-linux-gnu/libz.so
Я вижу символ определен в libz.so
$ nm -D /usr/lib/i386-linux-gnu/libz.so | grep compress
00001d60 T compress
00001c70 T compress2
00001da0 T compressBound
00003d20 T uncompress
Единственный способ, которым я могу заставить это работать, - это изменить команду gcc на это (добавлена жирная часть):
gcc -pthread -shared build/temp.linux-i686-2.7/external/KentLib/wWigIO/wWigIO.o -o build/lib.linux-i686-2.7/wWigIO.so -DMACHTYPE_x86_64 -lz -lm external /KentLib/lib/jkweb.a /usr/lib/i386-linux-gnu/libz.a
Это не имеет никакого смысла для меня. Почему бы Libz не связываться?
Попробуйте следующее: http://stackoverflow.com/questions/3373995/usr-bin-ld-cannot-find-lz ... и это: http://openacs.org/forums/message-view?message_id = 88831 –
@JoachimPileborg, он ссылается на него ... один из исходных файлов вызывает compress(). Этот исходный файл имеет #include –