Я пытаюсь реализовать алгоритм пушками с использованием MPI, я использую этот пример кода:Реализация Пушки алгоритма в MPI
http://siber.cankaya.edu.tr/ozdogan/GraduateParallelComputing.old/ceng505/node133.html
Там есть раздел, который я не понимая. вот пример кода.
37 /* Perform the initial matrix alignment. First for A and then for B */
38 MPI_Cart_shift(comm_2d, 0, -mycoords[0], &shiftsource, &shiftdest);
39 MPI_Sendrecv_replace(a, nlocal*nlocal, MPI_DOUBLE, shiftdest,
40 1, shiftsource, 1, comm_2d, &status);
41
42 MPI_Cart_shift(comm_2d, 1, -mycoords[1], &shiftsource, &shiftdest);
43 MPI_Sendrecv_replace(b, nlocal*nlocal, MPI_DOUBLE,
44 shiftdest, 1, shiftsource, 1, comm_2d, &status);
Это мой текущий код.
MPI_Comm_size(comm, &size);
MPI_Comm_rank(comm, &rank);
MPI_Cart_coords(comm, rank, 2, coordinates);
MPI_Cart_shift(comm, 0, -1, &rightrank, &leftrank);
MPI_Cart_shift(comm, 1, -1, &downrank, &uprank);
MPI_Cart_shift(comm, 0, -coordinates[0], &shiftsource, &shiftdest);
printf("coordinates[0] = %d for a shiftsource = %d, shiftdest = %d\n", coordinates[0], shiftsource, shiftdest);
//MPI_Sendrecv_replace(a, a->rowNum * a->colNum, MPI_INT, shiftdest,
//1, shiftsource, 1, comm, &status);
MPI_Cart_shift(comm, 1, -coordinates[1], &shiftsource, &shiftdest);
printf("coordinates[1] = %d for b shiftsource = %d, shiftdest = %d\n", coordinates[1], shiftsource, shiftdest);
//MPI_Sendrecv_replace(b, b->rowNum * b->colNum, MPI_INT,
// shiftdest, 1, shiftsource, 1, comm, &status);
Я называю MPI_Cart_create в другой функции, но это тот же самый основной вызов, как и в примере кода.
MPI_Comm_size (MPI_COMM_WORLD, &size); /* get number of processes */
.
.
.
if(is_perfect_square(size)) dim_size[0] = dim_size[1] = (int) sqrt(size);
else
{ //if size = 2 then dims = 2, 1; size = 4 then 2,2; 8 = 4, 2...
dim_size[0] = (int) sqrt(size + size);
dim_size[1] = dim_size[0]/2;
}
MPI_Cart_create(MPI_COMM_WORLD, 2, dim_size, periods, 1, &CannonsCart);
прямо сейчас Я просто пытаюсь понять, что такое точка shiftsource и shiftdest. Я предполагаю, что это для инициативного сдвига, но когда я запускаю этот код, мои заявления printf говорят об этом.
coordinates[0] = 0 for a shiftsource = 0, shiftdest = 0
coordinates[1] = 0 for b shiftsource = 0, shiftdest = 0
coordinates[0] = 1 for a shiftsource = 1, shiftdest = 1
coordinates[1] = 1 for b shiftsource = 2, shiftdest = 2
coordinates[0] = 1 for a shiftsource = 0, shiftdest = 0
coordinates[1] = 0 for b shiftsource = 2, shiftdest = 2
coordinates[0] = 0 for a shiftsource = 1, shiftdest = 1
coordinates[1] = 1 for b shiftsource = 0, shiftdest = 0
Я не понимаю, почему сменный источник и shiftdest одинаковы. Он должен быть один слева и один для матриц a и b.
Число процессов для этого вызова (размер I.E.) составляет 4 для этого тестового примера. Если мне нужно, я просто возьму весь мой код.
В настоящее время у меня есть сетка 2 на 2, и она периодична в обоих направлениях. Я получаю, как cart_shift вычисляет его направления сейчас, я до сих пор не понимаю, почему алгоритм Cannons имеет этот раздел кода. – AlexLordThorsen
Алгоритм использует круговые сдвиги. После последней итерации результат есть, но он неупорядочен. Для восстановления первоначального распределения данных необходим один дополнительный шаг, чтобы впоследствии его можно было собрать с использованием того же шаблона связи, что и для его рассеяния. –