grep только точные совпадения с рисунком

Question

Я хотел бы grep имена ростов, которые соответствуют моему шаблону toMatch.

toMatch <- c("I-A", "I-AA", "I-AAA") 
dat[grep(toMatch, rownames(dat)), ] 

Дат

hsa-miR-10b-5p_TACCCTGTAGAACCGAATTTGTAA_0;I-AA;0;g   3.939829e-01 
hsa-miR-122-5p_TGGAGTGTGACAATGGTGTTTGATA_0;I-ATA;0;0   3.942306e-01 
hsa-miR-122-5p_TGGAGTGTGGCAATGGTGTTTGAAA_10GA;I-AAA;0;0  3.948047e-01 

из

hsa-miR-10b-5p_TACCCTGTAGAACCGAATTTGTAA_0;I-AA;0;g   3.939829e-01 
hsa-miR-122-5p_TGGAGTGTGGCAATGGTGTTTGAAA_10GA;I-AAA;0;0  3.948047e-01 

Answer 1

Вы хотите grepl как она возвращает строку T/F. grep/grepl только принимает одну строку в качестве входных данных, она не может взять вектор, вы можете добавить | (значение или) между разными вещами до grep.

dat[grepl("I-A|I-AA|I-AAA", rownames(dat)), ] 

Answer 2

Библиотека stringr хороша для манипулирования строк,

dat <- dat[str_detect(dat$V1, toMatch),] 
dat 
#              V1  V2 
#1  hsa-miR-10b-5p_TACCCTGTAGAACCGAATTTGTAA_0;I-AA;0;g 0.3939829 
#3 hsa-miR-122-5p_TGGAGTGTGGCAATGGTGTTTGAAA_10GA;I-AAA;0;0 0.3948047