Предупреждающие сообщения C в R

Question

Я вызываю функцию R из пакета R e1071, который сопряжен с libsvm (программа C). Эта функция передает предупреждающие сообщения C (printf) в консоль R. Я знаю это, потому что предупреждающие сообщения имеют форму (предупреждение: ...), тогда как предупреждающие сообщения R заглавные (т. Е. Предупреждение: ...).

Я пробовал все, чтобы избавиться от этих сообщений в R (раковина, suppressWarnings, невидимая), но ничего не работает.

Любые идеи?

Спасибо!

Answer 1

Функция использует STDIO вместо Rprintf/REprintf или warning поэтому повторное направление выхода R не будет работать. Правильное решение - исправить вызовы в libsvm, чтобы вместо этого использовать R-выход.

Взлом выход STDIO возможно - вы можете перенаправить вывод в вашей собственной трубы и делать то, что вы хотите с ним, но а) это немного работы в С и б) это опасно, потому что вам нужно для восстановления стандартного поведения после того, как вы закончите работу с функцией, даже если это ошибка, и c) внутри может взаимодействовать с выходом R, если он используется в оболочке.

Если вы хотите действительно юродивый, грязный еще быстрое решение, запустить функцию в collect(parallel(..., silent=TRUE))[[1]] от multicore - он подавляет стандартный вывод (вы можете добавить multicore:::closeStderr() если вы хотите, чтобы подавить STDERR а).