Запись вывода ascii из массивов numpy

Question

Я хочу записать некоторые случайные числа в выходной файл ascii. я генерировать номера с NumPy, поэтому номера хранятся в numpy.array

import numpy as np 
random1=np.random.uniform(-1.2,1.2,7e6) 
random2=... 
random3=... 

Все три массива имеют одинаковый размер. Я использовал стандартный вывод файла, но это очень медленно. Всего около 8000 линий за 30 мин. Это может быть, потому что я перебираю три больших массива.

fout1 = open("output.dat","w") 

for i in range(len(random1)): 
    fout1.write(str(random1[i])+"\t"+ str(random2[i])+"\t"+ str(random3[i])+"\n") 
fout1.close() 

я просто использовал print str(random1[i])+"\t"+ str(random2[i])+"\t"+ str(random3[i]) и свалил все в файле usind оболочки ./myprog.py > output.dat, который, кажется, немного быстрее, но все-таки я не доволен скоростью вывода.

Любые рекомендации действительно приветствуются.

Answer 1

Я предполагаю, что диск io является самой дорогой операцией, которую вы делаете. Вы могли бы попытаться создать свой собственный буфер, чтобы справиться с этим, вместо того чтобы писать каждую строку в каждом буфере цикла, скажем, 100 строк и записать их в один большой блок. Затем поэкспериментировать с этим и посмотреть, что самый benficial размер буфера

Answer 2

Вы пробовали

random = np.vstack((random1, random2, random3)).T 
random.savetxt("output.dat", delimiter="\t")