Использование networkx с моим собственным объектом

Question

У меня есть свои собственные объекты, скажем, пепперони. У меня есть список ребер от каждого pepperoni и список pepperonis. Затем я создаю граф, используя networkx. Я пытаюсь найти вес кратчайшего пути от одного пепперони к другому. Тем не менее, я получаю сообщение об ошибке следующим образом, который отслеживает внутренние вещи из NetworkX следующим образом:

Traceback (most recent call last): 


File "<stdin>", line 1, in <module> 
    File "pizza.py", line 437, in shortestPath 
    cost = nx.shortest_path_length(a, spepp, tpepp, True) 
    File "/Library/Python/2.6/site-packages/networkx-1.3-py2.6.egg/networkx/algorithms/shortest_paths/generic.py", line 181, in shortest_path_length 
    paths=nx.dijkstra_path_length(G,source,target) 
    File "/Library/Python/2.6/site-packages/networkx-1.3-py2.6.egg/networkx/algorithms/shortest_paths/weighted.py", line 119, in dijkstra_path_length 
    (length,path)=single_source_dijkstra(G,source, weight = weight) 
    File "/Library/Python/2.6/site-packages/networkx-1.3-py2.6.egg/networkx/algorithms/shortest_paths/weighted.py", line 424, in single_source_dijkstra 
    edata=iter(G[v].items()) 
    File "/Library/Python/2.6/site-packages/networkx-1.3-py2.6.egg/networkx/classes/graph.py", line 323, in __getitem__ 
    return self.adj[n] 
KeyError: <pizza.pepperoni object at 0x100ea2810> 

Любая идея относительно того, что ошибка, или то, что я должен добавить к моему классу пиццы, чтобы не получить этот KeyError?

Редактировать: У меня есть правильные отрезки. Я не знаю, могут ли объекты обрабатываться как узлы.

Answer 1

Если у вас есть ребра и узлы каждый в качестве списка, то построение графика в networkx прост. Учитывая, что ваша проблема возникает в создании вашего объекта графа, возможно, лучшие диагностический должна пройти через построение графа в NetworkX шага за шагом:

import networkx as NX 
import string 
import random 

G = NX.Graph() # initialize the graph 

# just generate some synthetic data for the nodes and edges: 
my_nodes = [ ch for ch in string.ascii_uppercase ] 
my_nodes2 = list(my_nodes) 
random.shuffle(my_nodes2) 
my_edges = [ t for t in zip(my_nodes, my_nodes2) if not t[0]==t[1] ] 

# now add the edges and nodes to the networkx graph object: 
G.add_nodes_from(my_nodes) 
G.add_edges_from(my_edges) 

# look at the graph's properties: 
In [87]: len(G.nodes()) 
Out[87]: 26 

In [88]: len(G.edges()) 
Out[88]: 25 

In [89]: G.edges()[:5] 
Out[89]: [('A', 'O'), ('A', 'W'), ('C', 'U'), ('C', 'F'), ('B', 'L')] 

# likewise, shortest path calculation is straightforward 
In [86]: NX.shortest_path(G, source='A', target='D', weighted=False) 
Out[86]: ['A', 'W', 'R', 'D'] 

По моему опыту, NetworkX имеет чрезвычайно разрешительный интерфейс, в частности, он будет принимать широкий диапазон типов объектов в виде узлов и ребер. Узел может быть любым хешируемым объектом, кроме None.

Единственное, что я могу думать о том, что может привести к ошибке вы представлены в вашем Q является то, что, возможно, после того, как вы упаковали график вы непосредственно манипулировать объект графика (Dict, * G *), который ты не следует делать - существует множество методов доступа.