Группировка экологических данных в R

Question

Я изучаю некоторые экологические данные (диету) и пытаюсь выяснить, как группировать Predator. Я хотел бы иметь возможность извлекать данные, чтобы я мог смотреть на веса каждой отдельной жертвы для каждого вида для каждого хищника, т. Е. Вычислять средний вес каждого вида, съеденного, например, хищником 117. Я поставил образец моих данных ниже.

Predator PreySpecies PreyWeight 
1 114  10 4.2035496 
2 114  10 1.6307026 
3 115  1 407.7279775 
4 115  1 255.5430495 
5 117  10 4.2503708 
6 117  10 3.6268814 
7 117  10 6.4342073 
8 117  10 1.8590861 
9 117  10 2.3181421 
10 117  10 0.9749844 
11 117  10 0.7424772 
12 117  15 4.2803743 
13 118  1 126.8559155 
14 118  1 276.0256158 
15 118  1 123.0529734 
16 118  1 427.1129793 
17 118  3 237.0437606 
18 120  1 345.1957190 
19 121  1 160.6688815 

Answer 1

Вы можете использовать функцию aggregate следующим образом:

aggregate(formula = PreyWeight ~ Predator + PreySpecies, data = diet, FUN = mean) 

# Predator PreySpecies PreyWeight 
# 1  115   1 331.635514 
# 2  118   1 238.261871 
# 3  120   1 345.195719 
# 4  121   1 160.668881 
# 5  118   3 237.043761 
# 6  114   10 2.917126 
# 7  117   10 2.886593 
# 8  117   15 4.280374 

Answer 2

Есть несколько различных способов получить то, что вы хотите:

1. aggregate функция. Наверное, что вы после.

   aggregate(PreyWeight ~ Predator + PreySpecies, data=dd, FUN=mean) 
   

2. tapply: Очень полезный, но только делит переменную на один фактор, следовательно, нам нужно создать потребность совместного фактора с помощью команды вставки:

   tapply(dd$PreyWeight, paste(dd$Predator, dd$PreySpecies), mean) 
   

3. ddply: Часть пакет plyr. Очень полезно. Стоит учиться.

   require(plyr) 
   ddply(dd, .(Predator, PreySpecies), summarise, mean(PreyWeight)) 
   

4. dcast: Выход в большем количестве формате таблицы. Часть пакета reshape2.

   require(reshape2) 
   dcast(dd, PreyWeight ~ PreySpecies+ Predator, mean, fill=0) 
   

Answer 3

mean(data$PreyWeight[data$Predator==117]);