После некоторых исследований найденных, что вы могли бы загрузить продукт с этим кодом:
$objectManager = \Magento\Framework\App\ObjectManager::getInstance();
$product = $objectManager->create('Magento\Catalog\Model\Product')->load(PRODUCT ID);
вы можете получить доступный веб идентификаторов с помощью этой функции:
$product->getWebsiteIds();
Эта функция вернет аранжировку со всем веб-сайтом, на который будет работать продукт. и вы можете просто установить веб-сайт, как это:
$product->setWebsiteIds(array(1,2,3));
И сохранить, вызвать эту функцию:
$product->save();