На самом деле, самый простой способ изменить кучу ключей реестра - использовать *.reg file и просто загрузить его в реестр. Но будьте осторожны: вы вообще не можете отправлять эти файлы людям по электронной почте, потому что они фильтруются многими почтовыми серверами.
Мы иногда используем эту технику, чтобы передавать конфигурацию приложений и тестировать их на других машинах.
Я упоминаю это не программное решение, потому что вы предположили, что либо приложение C#, либо командный файл будут в порядке, что предполагает, что вы ищете что-то легкое, и вы не слишком беспокоитесь о деталях.
send-me-the-codez? :-D – Tomalak