1
Я запускаю модель coxph с помощью glmnet. Ниже приведен код, который я использую:R: glmnet - ошибка cox
data <- read.csv("CSM Tiers by Org.csv", stringsAsFactors = FALSE, na.strings = "?")
x <- model.matrix(~ data$CSM + data$Exclude + data$Queue)
y <- data$Time
status <- data$Event
glmnet(x,Surv(y,status), family = "cox")
Однако, я получаю следующее сообщение об ошибке:
Error in coxnet(x, is.sparse, ix, jx, y, weights, offset, alpha, nobs, :
negative event times encountered; not permitted for Cox family
Но я не вижу никаких отрицательных моментов времени событий в моих данных.
> sum(y<0)
[1] 0
Любая помощь очень ценится!
Без выполненных данных, чтобы сделать эту ошибку [воспроизводимую] (http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to- make-a-great-r-воспроизводимый пример), вам будет очень сложно помочь. – MrFlick
@MrFlick: Я пытаюсь загрузить данные ... но это слишком большой файл. – EsBee
Нам не нужен ваш точный входной файл. См. Советы по ссылке, предоставленной для создания репрезентативного набора входных данных. Этого должно быть достаточно, чтобы вызвать ту же самую ошибку, которую вы получаете. – MrFlick