CummeRbund csHeatmap: Способ настройки размеров текста идентификатора гена?

Question

Мне было интересно, знал ли кто-нибудь о способе изменения текстовых меток гена id для тепловыделения, созданного функцией csHeatmap() в пакете R CummeRbund? Я знаю, что это объект ggplot, но я не могу найти способ либо: 1) извлечь идентификаторы генов в том порядке, в котором они представлены на изображении, или 2) изменить их относительные размеры. Прямо сейчас размер текста слишком велик, чтобы его можно было прочитать.

Кто-нибудь сталкивался с этой проблемой?

Любые идеи будут оценены. Благодаря!

Answer 1

Думаю, я понял это после кучи Google-ing. Вы в основном передать тему на объект так же, как вы бы в ggplot ...

hmap <- csHeatmap(myGenes,cluster='both') 
hmap <- hmap + theme(axis.text.x=element_text(size=14),axis.text.y=element_text(size=6)) 

Где myGenes это имя вашего CuffGeneSet.

Удачи.