Экспортировать путь библиотеки и включить в perl

Question

У меня есть запрос относительно экспорта пути библиотеки &, который включает в себя для вызова варианта Platypus. Требуется htslib, и platypus установлены на сервере, и у меня нет прав sudo, чтобы их изменить.

Я пытаюсь использовать следующий код для экспорта библиотеки & для запуска вызывающего. Мне не хватает osmething, потому что я не могу его выполнить?

Код:

#!usr/perl-w 
use strict; 
use warnings; 

`export LIBRARY_PATH=/opt/htslib/lib/`; 
`export LD_LIBRARY_PATH=/opt/htslib/lib/`; 
`export INCLUDE_PATH=/opt/htslib/include/`; 
system ("python /opt/Platypus_0.8.1/Platypus.py callVariants --help"); 

Любой вид помощи был бы оценен.

Answer 1

Вы устанавливаете env vars только что сделанных оболочек, а не процесса Perl, который принадлежит родительскому python. Для этого необходимо следующее:

$ENV{LIBRARY_PATH} = '/opt/htslib/lib/'; 
$ENV{LD_LIBRARY_PATH} = '/opt/htslib/lib/'; 
$ENV{INCLUDE_PATH} = '/opt/htslib/include/'; 

Последняя строка кода лучше записать следующим образом, так как это позволяет избежать ненужной оболочки:

system("python", "/opt/Platypus_0.8.1/Platypus.py", "callVariants", "--help");