C++ Биологический подсчет клеток с OpenCV

Question

Я относительно новичок в OpenCV, и у меня нет сильного фонового изображения. В настоящее время я работаю над проектом, чтобы написать программу для подсчета всех биологических клеток из микроскопа в изображении. Я попробовал различные методы из интернет-источников, чтобы применять подсчет изображений, но никто из них не работает хорошо, как ожидалось.

Некоторые из методов, которые я использовал являются:

1. Поиск контуров фильтрованного изображения. (не работает хорошо с соседними ячейками)
2. Размытие по Гауссу и поиск локальных максимумов на изображении. (Тот же проблема, как)
3. оператора кэнний (выходной результат обнаружить негерметичность сегмента клеток)

Это пример изображений мне нужно подсчитать общее число клеток.

Мой текущий алгоритм подсчета работает лучше, если клетки не близко друг к другу. Так, например, как это:

Однако алгоритм еще не разделены друг от друга на 3 клетки, которые наклеить вместе в центре изображения.

Так что я могу сделать, чтобы обнаружить общее количество ячеек в изображении с наименьшим ложным отрицательным/положительным?

Answer 1

Ваш подход почти прекрасен. Однако для этого необходимы дополнительные шаги. Вам нужно что-то под названием Morphological Operations.

1. Отфильтруйте свое изображение так, как будто вы хорошо.
2. Примените пороговое значение в зависимости от цвета или преобразуйте его в серый, затем установите пороговое значение. Постскриптум из приведенных вами примеров, кажется, что ваш цвет ячейки слишком насыщен. Таким образом, вы можете преобразовать его в HSV Space, а затем установить его по каналу S (скажите, нужна ли вам помощь здесь).
3. Применить Opening Морфологические операторы на пороговом изображении. Постскриптум вы можете попробовать несколько размеров ядра и выбрать лучшее.
4. Возьмите контуры и сделайте то, что делаете.

Открытие:

cv::Mat element = cv::getStructuringElement(cv::MORPH_RECT, cv::Size(5, 5), cv::Point(1, 1)); 
cv::morphologyEx(img, img, cv::MORPH_OPEN, element, cv::Point(-1, -1), 1);