Я не могу найти эквивалентное преобразование graph_from_data_frame, присутствующего в R во что-то в PythonIGRAPH из R кода варианта Python
То, что я сделал это:
graph_from_data_frame(d = dataframe_1[,c("ID_TO","ID_FROM")], directed = TRUE, vertices = sort(unique(unlist(dataframe_1))))
Выход выше:
IGRAPH DN-- 195 201 --
+ attr: name (v/c)
+ edges (vertex names):
[1] 46753->46627 46737->46642 46753->46629 46737->46629 46646->46600 enter code here... (and so on)...
Что я пытался в питона следующее:
# Convert dataframe to matrix
edges = dataframe_1.as_matrix(columns=None)
# create directed graph
MAP = Graph.TupleList(directed=True, edges = edges)
Это дало мне ниже вывод, который является неправильным (я получаю вывод в обратном порядке), вероятно, потому, что я не смог выполнить сортировку (уникальный (unlist())) вариант в python. Но я не уверен. Выхода из питона кода:
IGRAPH DN-- 339 201 --
+ attr: name (v)
+ edges (vertex names):
46627->46753, 46642->46737, 46629->46753, 46629->46737, 46600->46646
Я узнал, что нет прямого варианта graph_from_data_frame в R во что-нибудь в Python, но любой ведущего к такому подходу и этот результат ценятся.
Выборочные данные из dataframe:
ID_FROM ID_TO
0 46627 46753
1 46642 46737
2 46629 46753
3 46629 46737
4 46600 46646
5 46552 46633
Я прошел через многие результаты от Google дифференцируя о IGRAPH в R против Python, но ничего не помогло ГУП-случае, я работаю.
вы можете '' dput' ваш образец frame' данных? –
@SandipanDey - Я также обновил выше данные. Порядок вершин - это то, что я думаю, что-то неправильно. –
@SandipanDey - также 'dput' данных выглядит следующим образом: '> dput (dataframe_1) структура (список (ID_FROM = с ("46627", "46642", "46629", "46629", «46600», «46552»), ID_TO = c («46753», «46737», «46753», «46737», «46646», «46633»), .Names = c («ID_FROM», " ID_TO "), row.names = c (NA, -201L), class =" data.frame ")' –