Чтобы создать пользовательскую палитру, определить ваши кисти вручную в вашем App.xaml например:
<!-- primary hues -->
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueLightBrush" Color="LightBlue"/>
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueLightForegroundBrush" Color="Black"/>
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueMidBrush" Color="Blue"/>
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueMidForegroundBrush" Color="White"/>
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueDarkBrush" Color="DarkBlue"/>
<SolidColorBrush x:Key="PrimaryHueDarkForegroundBrush" Color="White"/>
<!-- accent -->
<SolidColorBrush x:Key="SecondaryAccentBrush" Color="Yellow"/>
<SolidColorBrush x:Key="SecondaryAccentForegroundBrush" Color="Black"/>
В этом примере вы бы не сливаться в ваши два палитры из сборки цветов.
Для получения дополнительной информации см:
https://github.com/ButchersBoy/MaterialDesignInXamlToolkit/wiki/Custom-Palette-Hues