Пространственная трансформация томов

Question

У меня есть 2 тома изображений nifti, которые я хотел бы отображать вместе с помощью XTK. Оба они уже конвертированы в NRRD с использованием соответствующих модулей ITK от Mevislab. Оба тома были получены в том же сеансе МРС, но они отличаются пространственным разрешением и поле зрения (даже с ориентацией), поэтому важно, чтобы XTK учитывал поля «космические направления» и «космическое происхождение» NRRD для отображения их правильно с точки зрения относительной пространственной позиции. На практике это, однако, не происходит.

Я уже прочитал вопрос и ответ на исправление части «пространства происхождения», но он все еще сталкивается с проблемами с «космическими направлениями». Мои последние попытки пытались изменить преобразование томов после их загрузки, но это, похоже, не влияет на отображаемые тома. Однако я мог успешно сделать это с помощью файла TRK-волокна, но изменение трансакции тома не дает никаких эффектов. Итак, вопрос заключается в следующем: как правильно загрузить (NRRD) том и принимая во внимание его полную пространственную трансформацию в пространство пациента/сканера, так что несколько загруженных томов правильно совпадают?

Заранее благодарим за любую помощь!

Answer 1

К сожалению, ориентация сканирования на данный момент не учитывается. Это должно произойти вскоре, так как это очень важно.

В качестве обходного пути можно преобразовать каждый кусочек тома с помощью методов преобразования. Вы в основном петляете через детей, а затем применяете к каждому преобразование.

Если вы готовы внести свой вклад в парсер, было бы здорово! Кроме того, теперь поддерживается формат NII, поэтому вам не нужно преобразовывать (намного медленнее) NRRD.