Какой полезный пакет R в настоящее время не существует?

Question

Я работал над несколькими пакетами R для некоторых общих инструментов, которые в настоящее время недоступны в R: блоги, доставка отчетов, ведение журнала и планирование. Это заставило меня задуматься: какие самые важные вещи люди пожелали существуют в R, которые в настоящее время недоступны?

Я надеюсь, что мы сможем использовать это, чтобы выявить некоторые пробелы и, возможно, работать на них совместно.

Answer 1

Естественный интерфейс к платформе .NET был бы потрясающим, хотя я подозреваю, что это может быть большой работой.

EDIT: Подсветка синтаксиса изнутри RGui также будет замечательной.

ДРУГОЕ ИЗМЕНЕНИЕ: R.NET теперь существует для интеграции R с .NET.

Answer 2

Интерфейсы к любой из новых фальсифицированных баз данных «Web 2.0», в которых используются пары «ключ-значение», а не стандартная RDMS. Неполный список (в алфавитном порядке) будет

• Cassandra Project
• CouchDB
• MongoDB
• Project Voldemort
• Redis
• Tokyo Cabinet

, и было бы неплохо, если бы у нас была абстракция DBI. Джефф начал с RBerkeley, но использовал бэкэнд Oracle BerkeleyDB в старой школе, а не одну из этих новых вещей.

Answer 3

Существует несколько библиотек для взаимодействия с базой данных в целом, и нет библиотеки ORM.

RMySQL полезен, но вы должны писать SQL-запросы вручную, и нет возможности их генерировать, как в ORM. Morevoer, он специфичен только для MySQL.

Еще один набор библиотек, который R еще не имеет, для меня это хорошая система для чтения аргументов командной строки: есть R getopt, но это не похоже, например, argparse в python.

Answer 4

Пакет Real-Time R был бы моим выбором, возможно, с помощью C Streaming.

Также я хотел бы получить более надежный пакет веб-разработки. Ничего такого масштабного, как Ruby on Rails, но немного лучше, чем Sweave в сочетании с R2HTML, который может работать на RApache. Я думаю, что это должно быть огромной областью внимания для R в целом.

Я понимаю, что LaTeX - лучшая разметка для определенных академий, но в целом я считаю, что HTML должен быть языком разметки по выбору. Больше нужно делать с точки зрения R Web Apps, поэтому приложения могут размещаться на огромной ОЗУ удаленно, а R может использоваться для приложений данных SaaS и других графических решений.

Answer 5

Собственный интерфейс .NET для RGUI. R (D) Com основан на COM, и он позволяет только обменивать матрицы, а не более сложные структуры.

Answer 6

Я бывший наркоман Mathematica, и одна вещь, которую я действительно пропустил, это интерфейс стиля ноутбука. Когда я проводил исследования с помощью ноутбуков, бумаги писали бы сами, как и мой анализ. Но теперь, когда я использую R, я считаю, что документирование моей работы было довольно утомительным.

Для людей, которые не знакомы с Mathematica, у вас есть документы, называемые «ноутбуками», которые могут содержать код, текст, уравнения и результаты выполненного кода (которые могут быть уравнениями, текстом, графикой или интерактивными инструментами) , Все может быть аккуратно организовано в стилизованные подразделы или разделы, которые сжимаются. У вас может быть несколько открытых документов, которые интегрируются с одним общим ядром.

Хотя я не думаю, что полномасштабный интерфейс стиля Mathematica абсолютно необходим, некоторая интерактивная система документов, которая поддерживала бы текст (для описания), код, вывод кода и выход встроенного изображения, была бы настоящим благом для исследователей ,

Answer 7

Устройство вывода, которое создает код Javascript, возможно, используя библиотеку протовиз.

Answer 8

Я бы хотел, чтобы пользователи могли вставлять другой язык программирования в R более простым способом. Я даю это в качестве примера, в некоторых вариантах реализации общего LISP можно написать функцию с внедренным кодом C, например так:

(defun sample (x) 
    (ffi:c-inline (n1 n2) (:int :int) (values :int :int) "{ 
    int n1 = #0, n2 = #1, out1 = 0, out2 = 1; 
    while (n1 <= n2) { 
     out1 += n1; 
     out2 *= n1; 
     n1++; 
    } 
    @(return 0)= out1; 
    @(return 1)= out2; 
    }" 
    :side-effects nil)) 

Было бы хорошо, если можно было бы написать функцию R со встроенным C или LISP кода (более заинтересованные в последнем) аналогичным образом.

Answer 9

как программист и писатель библиотек для коллег, мне определенно не хватало регистрационного пакета, я искал google и просил около here too, а затем написал сам. он находится на r-forge, here, и это называется «вырубка леса» :)

Я использую его, и я, очевидно, все еще его разрабатываю.

Answer 10

Я бы очень хотел использовать профилировщик линии. Это существует в Matlab и Python и очень полезно для поиска битов кода, которые занимают много времени или выполняются больше (или меньше), чем ожидалось. Многие из моих кодов включают в себя оптимизацию функций и сколько раз что-то итерации могут быть неизвестны заранее (хотя большинство итераций ограничены или указаны).

Стек вызовов полезен, если весь ваш код находится в R и очень прост, но как I recently posted about it, он требует много усилий, если ваш код является сложным.

Достаточно просто разработать профилировщик строк для заданного бита кода. Наивный способ - индексировать каждую строку (или только предварительно определенные разделы) и вставлять вызов в журнал proc.time() этой строки. В цикле я просто перечисляю разделы кода и сохраняю в двумерном списке значения proc.time для раздела i на итерации k. [См. Обновление ниже: на самом деле это не способ сделать профилировщик строк для всех видов кода.]

Можно использовать такой инструмент для поиска горячих точек, аномалий (например, код, который должен быть O (n), но на самом деле O (n^2)), код, который может извлечь выгоду из memoization (профилировщик строк не говорит вам об этом, но он позволяет вам знать, где искать), код, который ошибочно находится внутри цикла, и многое другое.

Обновление 1: Вставка линии синхронизации между каждой функциональной строкой немного ошибочна: определение строки кода не просто кода, разделенного пробелом. Возможность анализа кода в АСТ необходима для того, чтобы знать, где начинаются и заканчиваются операции.Как было сказано в некоторых ответах на this question, есть несколько инструментов (а именно showTree и walkCode в пакете codetools) для этого. Простое применение регулярного выражения к исходному коду было бы очень плохим делом.

Answer 11

A FRAQ пакет для вопросов, связанных с FRequently, a la fortune(). R-помощь будет очень весело:. «Попробуйте это, library(FRAQ); faq("lattice won't print") и т.д.

See also.

Answer 12

wiki пакет, который добавляет вики-как документацию на пакеты R Вы хотите иметь inst/wiki подкаталог с простыми текстовыми файлами в markdown, asciidoc, текстиль, с внедренным кодом R. С правильным заклинанием эти файлы будут выполнены (подумайте brew и/или asciidoc) и соответствующий вывод, загруженный в данный репозиторий онлайн (github, googlecode и т. д.), . Еще одна функция могла позаботиться о синхронизации сделанных изменений , обычно через svn или git.

Внезапно у вас есть вики-документация для вашего пакета с воспроизводимыми примерами (может даже быть подключена к R CMD check).

EDIT 2012:

... и теперь knitr пакет будет сделать этот процесс еще проще и аккуратнее