Создание пакета для Mac в Windows/Linux

Question

Я стараюсь сделать сам пакет r. Я выполнил инструкцию в предыдущем вопросе в stackoverflow на how to develop package for layman. Вот шаги, которые я делаю после предыдущего вопроса.

1. Run R код в свежей R сессии

   # random DNA function 
   randDNA = function(n){ 
   paste(sample(c("A", "C", "T", "G"), n, replace = TRUE), collapse = "") 
   } 
   # DNA to RNA function 
   dna2rna <- function(inputStr) { 
       if (!is.character(inputStr)) 
       stop("need character input") 
       is = toupper(inputStr) 
       chartr("T", "U", is) 
   } 
   
   # complementary sequence function 
   compSeq <- function(inputStr){ 
   chartr("ACTG", "TGAC", inputStr) 
   } 
   
   # example data 
   dnaseq1 <- c("ATTGTATCTGGGTATTTCCCTTAATTGGGGCCTTT") 
   dnaseq2 <- c("TGGGGTAAACCCGGTTTAAAATATATATATTTTT") 
   myseqdata <- data.frame(dnaseq1, dnaseq2) 
   save(myseqdata, file = "myseqdata.RData") 
   

2. Установите Rtools Установите R пакет utils

3. Pefrom следующие задачи в R

   require(utils) 
   package.skeleton(list = c("randDNA","dna2rna", "compSeq", "myseqdata"), 
   name = "dnatool",environment = .GlobalEnv, path = "c:", force = FALSE) 
   

4. Редактировать системное окружение Переменный путь к следующим в окнах 7

   C:\Rtools\bin;C:\Rtools\perl\bin;C:\Rtools\MinGW\bin; 
   C:\Program Files\R\R-2.14.2\bin\x64; 
   

   (типа >path в командной строке, чтобы проверить, если путь установлен правильно.

5. Скопируйте папку dnatool на стадии (3) и поместить в новую папку с именем rpackage, Теперь измените каталог в эту папку (в DOS)

   c: \ repackage> R CMD build dnatool 
   c: \ repackage> Rcmd build dnatool 
   

   Edit: Я когда-то получаю dnatool.zip но другие времена dnatool.tar.gx

6. Проверка пакета в командной строке (DOS)

   c: \ repackage> R CMD check dnatool 
   

Я смог упаковать его в виде «dnatool.zip» в окнах.

Как скомпилировать для источника MAC или unix? Какие шаги разные?

Unix source:  dnatool.tar.gz 
Mac OS X binary: dnatool.tgz 

Нужен ли мне компьютер Mac. У меня есть linux virtualbox и установлен в нем ubuntu?

Edit:

Должен ли я использовать следующий commad, чтобы получить sourcode бинарного со стадией (3) dnatool папок?

$ tar -zcvf dnatool.tar.gz/home/dnatool 

Answer 1

Пакет, который был создан с использованием R CMD build, может быть установлен на другие типы ОС. Даже если ваш пакет содержит исходный код, отличный от R (c или C++), это так. Только когда вы создаете двоичный дистрибутив (я думаю, добавив --binary в вызов сборки r cmd), пакет становится специфичным для платформы. Инструменты, необходимые для сборки пакетов, часто уже устанавливаются под Linux или Mac. Поэтому, если вы создаете исходный дистрибутив, он должен работать во всех основных дистрибутивах. Чтобы создать двоичный файл mac, вам нужен либо макрос, либо создать среду кросс-компилятора. Второй вариант может быть довольно сложным, я говорю, что вы можете дать Google. Обратите внимание, что если вы загружаете свой пакет в CRAN, для вас будет создано все пакеты пакетов.