печать линии с матчем и следующей строкой, но только первым матчем, из файла строк

Question

У меня есть два файла, один с новой строкой список разделенной числовых идентификаторов

>cat list.txt 
3342 
232 
... 

и один с этими идентификаторами и некоторой последовательностью данные в строке после

>cat Seqeunce.txt 

>600 
ATCGCGG 
>3342 
ACTCGGTC 
>232 
TGTGCT 
>3342 
ACGCGGTC 

Я хотел бы, чтобы напечатать все строки с спичкой ID и в следующей строке, но только в первый раз найдено совпадение. Таким образом, из пут будут:

> ...some code... list.txt Sequence.txt 
>3342 
ACTCGGTC 
>232 
TGTGCT 

Обратите внимание, что только строка с первым появлением ID 3342, а в следующей строке, печатается

Я попытался с помощью Grep,

grep -f list.txt -A 1 -m 1 Sequence.txt 

Но он не работал. Просто запуск grep -A 1 и -m 1 с фактическим идентификатором создавал то, что я хочу, но у меня есть тысячи идентификаторов и не могу запускать их вручную.

Answer 1

Вы так близко. Дайте это попробовать:

for id in `cat list.txt`; do grep -A 1 -m 1 -x ">$id" Sequence.txt; done 

Answer 2

awk 'NR==FNR{tgts[">"$0]; next} $0 in tgts{c=2; delete tgts[$0]} c&&c--' list.txt sequence.txt 
>3342 
ACTCGGTC 
>232 
TGTGCT 

Answer 3

Вы можете использовать эту команду AWK:

awk -F'>' 'NR==FNR{a[$1];next} $2 in a{p=1; print; delete a[$2]; next}; 
     p; {p=0}' list.txt Sequence.txt 
>3342 
ACTCGGTC 
>232 
TGTGCT