Перестройки неопрятных и несбалансированный набор данных от широкоугольных до длинного

У меня есть набор данных (данные), который выглядит следующим образом:Перестройки неопрятных и несбалансированный набор данных от широкоугольных до длинного

ID,ABC.BC,ABC.PL,DEF.BC,DEF.M,GHI.PL 
SB0005,C01,D20,C01a,C01b,D20 
BC0013,C05,D5,C05a,NA,D5

Я хочу, чтобы изменить его от широкоугольных к длинному формату, чтобы получить что-то вроде этого:

ID,FC,Type,Var 
SB0005,ABC,BC,C01 
SB0005,ABC,PL,D20 
SB0005,DEF,BC,C01a 
SB0005,DEF,M,C01b 
SB0005,GHI,PL,D20 
BC0013,ABC,BC,C05 
BC0013,ABC,PL,D5 
BC0013,DEF,BC,C05a 
# BC0013,DEF,M,NA (This row need not be in the dataset as I will remove it later) 
BC0013,GHI,PL,D5

Обычный пакет переформатирования не работает, поскольку набор данных не сбалансирован. Я также попробовал Reshape из splitstackshape, но это не дает мне то, что я хочу.

library(splitstackshape) 
vary <- grep("\\.BC$|\\.PL$|\\.M$", names(data)) 
stubs <- unique(sub("\\..*$", "", names(data[vary]))) 
Reshape(data, id.vars=c("ID"), var.stubs=stubs, sep=".") 

ID,time,ABC,DEF,GHI 
SB0005,1,C01,C01a,D20 
BC0013,1,C05,C05a,D5 
SB0005,2,D20,C01b,NA 
BC0013,2,D5,NA,NA 
SB0005,3,NA,NA,NA 
BC0013,3,NA,NA,NA

Цените любые предложения, спасибо!

Обеспечение выхода dput(data) по запросу

structure(list(ID = structure(c(2L, 1L), .Label = c("BC0013", 
"SB0005"), class = "factor"), ABC.BC = structure(1:2, .Label = c("C01", 
"C05"), class = "factor"), ABC.PL = structure(1:2, .Label = c("D20", 
"D5"), class = "factor"), DEF.BC = structure(1:2, .Label = c("C01a", 
"C05a"), class = "factor"), DEF.M = structure(1:2, .Label = c("C01b", 
"NA"), class = "factor"), GHI.PL = structure(1:2, .Label = c("D20", 
"D5"), class = "factor")), .Names = c("ID", "ABC.BC", "ABC.PL", 
"DEF.BC", "DEF.M", "GHI.PL"), row.names = c(NA, -2L), class = "data.frame")

источник

2016-09-27 phusion

Просьба представить выход 'dput (данные)' в ваш вопрос, чтобы мы могли воспроизвести ваши усилия. – Chrisss

Как он неуравновешен? Вы имеете в виду «NA», которые вы хотите сбросить? Кроме того, должна ли последняя строка ожидаемого вывода 'D5' не' D20'? –

Вы правы, я исправил ошибку. Он неуравновешен, потому что BC, PL и M не отображаются во всех FC, например. BC появляется в ABC и DEF, а не в GHI. – phusion

Вы должны изменить свои данные в длинный формат, а затем вы можете плюнуть переменную колонку в столбцы. С splitstackshape вы могли бы сделать:

library(splitstackshape) # this will also load 'data.table' from which the 'melt' function is used 
cSplit(melt(mydf, id.vars = 'ID'), 
     'variable', 
     sep = '.', 
     direction = 'wide')[!is.na(value)]

что приводит:

      ID value variable_1 variable_2 
1:     SB0005 C01  ABC   BC 
2:     BC0013 C05  ABC   BC 
3:     SB0005 D20  ABC   PL 
4:     BC0013 D5  ABC   PL 
5:     SB0005 C01a  DEF   BC 
6:     BC0013 C05a  DEF   BC 
7:     SB0005 C01b  DEF   M 
8:     SB0005 D20  GHI   PL 
9:     BC0013 D5  GHI   PL

Альтернативным с tidyr:

library(tidyr) 
mydf %>% 
    gather(var, val, -ID) %>% 
    separate(var, c('FC','Type')) %>% 
    filter(!is.na(val))

источник

2016-09-27 06:13:02 Jaap

Перестройки неопрятных и несбалансированный набор данных от широкоугольных до длинного

ответ

Смежные вопросы