Выполнение команды в строке в bash

Question

У меня есть строка, содержащая команду, которую я хочу выполнить в сценарии bash. Как я могу это сделать? Извините за такой базовый вопрос, но я новичок в bash. Это мой код:

echo "What is the path to save the result files?" 
read out_path 

end_cm1=$"fastqc -o "$out_path$" --noextract -fastq "$files1 

И я хочу, чтобы выполнить команду, которая находится в переменной end_cm1.

Answer 1

Во-первых, вы не должны поместить эту команду в строке на все: вы можете просто сделать это:

fastqc -o "$out_path" --noextract -fastq $files1 

(И я бы рекомендовал положить $out_path в кавычки здесь в случае, если путь имеет пространство в нем. Я не ставил $files1 в кавычки, потому что ваша переменная множественна, поэтому я предполагаю, что существует более одного, вы также должны быть в местах с именами файлов.)

Во-вторых, ответ на заданный вами вопрос is eval:

eval $end_cm1 

Answer 2

Вы просто небольшой вопрос синтаксиса в строке:

end_cm1="fastqc -o $out_path --noextract -fastq $files1" 
$enc_cm1 

Сказав, что, @ams прав насчет не нуждаясь присвоить эту строку в первую очередь, и о связанных с этим рисков в не цитировании $files1.