Как редактировать и отлаживать источники библиотеки R

Question

Я включил библиотеку, названную blotter в моем R-скрипте, в которой есть ошибка. Есть ли простой способ изменить исходный код, чтобы попробовать и отладить проблему?

Answer 1

Посмотрите на функции trace и browser, они являются основными инструментами в R для отладки. Допустим, вы хотите изменить источник функции foo, то говоря

trace("foo",edit=TRUE) 

откроет источник обув в редакторе для вас изменить. Однако это для интерактивной отладки; исходные файлы в пакетах не изменяются. Поэтому, как только вы обнаружили ошибку, вам нужно изменить исходные файлы пакета, чтобы изменения были постоянными.

Answer 2

Такая возможность реализована в разрабатываемой версии R (16 июля 2010):

новый объект был добавлен г-разви для экспериментов авторами пакетов.

Идея состоит в том, чтобы вставить модифицированный код из источника пакета в рабочий пакет без повторной установки. Таким образом, можно быстро изменить, проверить, изменить, и т. Д.

Механизм предназначен для оценки некоторых файлов исходного кода, возвращающего объект окружения , который представляет собой моментальный снимок кода. Из этого среда, функции и методы могут быть вставлены в среду пакета в текущем сеансе. Вставка использует механизм trace() , поэтому исходный код можно восстановить.

Одношаговая версия:

insertSource("mySourceFile.R", package = "myPackage", functions = "foo")

Посмотреть этот пост для получения более подробной информации: Inserting and testing revised functions in a package

Answer 3

Ваш вопрос есть простой способ для меня, чтобы изменить источник на попробовать и отладить проблему? имеет очевидный ответ: используйте источник, Люк!

blotter - это пакет на R-Forge, откуда вы можете получить blotter sources here. Это стандартный способ взглянуть на Open Source и, возможно, помочь ему вместе с исправлением ошибок.