2015-01-30 3 views
0

Я пытаюсь установить samtools() на cygwin. Я следил за различными трюками here и here, но, похоже, моя проблема в том, что я не могу работать pthread. установлен НКУ и работы, устанавливается и работает zlib и устанавливается ncurses и работы + все было добавлено в $ PATH ... но когда я бегу make и он попадает в следующую строку в Makefile:gcc не может найти phtread в cygwin

gcc -pthread $(LDFLAGS) -o [email protected] $(AOBJS) libbam.a $(HTSLIB) $(LDLIBS) $(LIBCURSES) -lm -lz 

, то он выдает ошибку, потому что не распознает команду unix -pthread. теперь ... pthread должен быть частью установки по умолчанию в cygwin, поэтому я не понимаю, почему это не работает ...

любой подсказку было бы здорово!

ответ

0

gcc's option -pthread не доступен на Cygwin.