Инициирование положение просто делается путем установки сх и позиции Сая. Самое логичное место, где радиус в настоящее время устанавливается, т.е.
.attr("r", 10)
.attr("cx", 5) //added
.attr("cy", 5) //added
Конечно, вы можете сделать что-то более экзотическое, если вы используете связанные данные для инициализации позиции.
Это только установит отправную точку, хотя - компоновка силы затем захватит и поместит элементы. Преимущество состоит в том, что вы можете потенциально уменьшить некоторые из начальных движений узла, если вы это исправите.
Что вы сделали до сих пор? –