NetworkX: построение графика в циклю возвращает неправильный график

Question

Я работаю с регулярной сетью (сетки), которые я создаю, как:

import networkx as nx 
N=100 
def graph_creating(N): 
    G=nx.grid_2d_graph(N,N) 
    pos = dict((n, n) for n in G.nodes()) #Dictionary of all positions 
return G, pos 

У меня есть два способа итерации коды. В обоих случаях я удаляю узлы из сети и пытаюсь их нарисовать. В зависимости от того, создаю ли я сеть вначале или внутри цикла, я получаю другое поведение, когда я его создаю.

Моя проблема: Я хочу, чтобы построить сетку после этапа 1 и после 2-й ступени, поэтому для сравнения с неизмененной сетки/графика. Я не в состоянии сделать это правильно, потому что:

• Если исходная сетка создается внеfor петли, я правильно получить первые участки, но позже участки пусты, как граф никогда не восстанавливается обратно в неизмененном STATU;
• Если исходная сетка создана внутри цикл for, я всегда получаю неизменную сетку, как если бы удаление не повлияло на нее.

Где еще должен быть размещен граф-блок, чтобы иметь возможность строить график сразу после этапа 1 и 2?

версия 1 граф создается вне цикла for:

G, pos = graph_creating(N) 
nodelist = G.nodes() 
for counter in range(5): 
    G1 = nodelist[2*counter:2*counter+1] 
    G.remove_nodes_from(G1) 
    nx.draw_networkx(G, pos = pos) 
    figurename = 'file{0}.png'.format(counter) 
    plt.savefig(figurename) 

    G2=nodelist[2*counter+1:2*counter+2] 
    G.remove_nodes_from(G2) 
    nx.draw_networkx(G,pos=pos) 
    #it's not clear from your original question if you save this figure or not 

Результат: только первая итерация производит правильные участки. Позже графики пусты, так как график никогда не восстанавливается до неизмененного состояния.

версия 2 график создается внутри цикла for:

for counter in range(5): 
    G, pos = graph_creating(N) 
    nodelist = G.nodes() 
    G1 = nodelist[2*counter:2*counter+1] 
    G.remove_nodes_from(G1) 
    nx.draw_networkx(G, pos = pos) 
    figurename = 'file{0}.png'.format(counter) 
    plt.savefig(figurename) 

    G2=nodelist[2*counter+1:2*counter+2] 
    G.remove_nodes_from(G2) 
    nx.draw_networkx(G,pos=pos) 
    #it's not clear from your original question if you save this figure or not 

Результат: вызовы к nx.draw_networkx результат в неизмененном графа быть построены для каждой итерации. Интересно, проблема в том, как я называю эту функцию, поскольку она всегда отображает график без неудачных узлов. Почему у меня проблема с этим рисунком?.

Answer 1

• Сделайте свой график, создавая блок вне цикла for.
• Внутри для цикла создать копию графа с помощью tmp_G = G.copy()
• при использовании draw_netwokx или remove_nodes_from Используйте tmp_G вместо G
• Если вы хотите сравнить видоизмененные графики для оригинального одного звонка функция draw_networkx с помощью графа G