0
я не знаю, где я должен поставить как method=”spearman” в кодах corrplot, чтобы увидеть значение sperman корреляцииCorrplot значение
cor.mtest <- function(mat, conf.level = 0.95){
mat <- as.matrix(mat)
n <- ncol(mat)
p.mat <- lowCI.mat <- uppCI.mat <- matrix(NA, n, n)
diag(p.mat) <- 0
diag(lowCI.mat) <- diag(uppCI.mat) <- 1
for(i in 1:(n-1)){
for(j in (i+1):n){
tmp <- cor.test(mat[,i], mat[,j], conf.level = conf.level)
p.mat[i,j] <- p.mat[j,i] <- tmp$p.value
lowCI.mat[i,j] <- lowCI.mat[j,i] <- tmp$conf.int[1]
uppCI.mat[i,j] <- uppCI.mat[j,i] <- tmp$conf.int[2]
}
}
return(list(p.mat, lowCI.mat, uppCI.mat))
}
res1 <- cor.mtest(mtcars,0.95)
добавить 'method = 'spearman'' к аргументам в вашей функции' cor.mtest', чтобы он был по умолчанию (и пользователь может изменить его позже, если это необходимо). Вам также нужно добавить 'method = method' в строку' tmp <- cor.test' – rawr
Это не очень эффективная реализация этого. Однако основная проблема заключается в том, что он не корректирует значения p.values для множественного тестирования. – Roland