Это была серьезная ошибка (KT-10221) в автоматическом создании конфигурации запуска в плагине версии 0.4.0. Он был исправлен в 0.5.0, поэтому рекомендуемый способ обхода - обновить плагин.
Источником проблемы было то, что плагин использовал старый шаблон для генерации имени класса для основной функции, который был оставлен компилятором Kotlin.
Это можно обойти путем редактирования конфигурации запуска (Затмение меню -> Run -> Run Configurations ...) вручную и изменения основного класса поле в Java Application группы. Если файл имеет имя hello.kt без директивы пакета, как описано в учебнике, то исправленная строка должна быть HelloKt.
Если файл имеет имя other.kt с пакетом my.tutorial чем главного класса должен содержать my.tutorial.HelloKt. Вы можете узнать об этом подробнее в разделе Package-Level Functions от Вызов Kotlin с Java страница.