Я пытаюсь преобразовать старый код sqlite3 в sql alchemy. Я пытаюсь понять, как лучше всего использовать мой прецедент. Я новичок в методе доступа к базе данных ORM.динамические имена таблиц с SQLalchemy
Я пытаюсь динамически генерировать уникальные имена таблиц на основе общего определения. Я прочитал mixins guide, а также сообщение о том, как использовать type
to dynamically declare classes, но я до сих пор не уверен, как бы я это сделал. Вот то, что я до сих пор:
from sqlalchemy.ext.declarative import declarative_base
from sqlalchemy import Table, Column, Integer, String, MetaData, ForeignKey
from sqlalchemy.ext.declarative import declared_attr
Base = declarative_base()
class DynamicName(object):
@declared_attr
def __tablename__(cls):
return cls.__name__.lower()
class Genome(DynamicName, Base):
__tablename__ = 'AbstractGenome'
AlignmentId = Column(Integer, primary_key=True)
StartOutOfFrame = Column(Integer)
BadFrame = Column(Integer)
def build_genome_table(genome):
d = {'__tablename__': genome}
table = type(genome, (Genome,), d)
return table
Если я пытаюсь использовать это, он не работает:
>>> from sqlalchemy import create_engine
>>> engine = create_engine('sqlite:///:memory:', echo=True)
>>> genomes = ["A", "B"]
>>> tables = {x: build_genome_table(x) for x in genomes}
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "<stdin>", line 1, in <dictcomp>
File "<stdin>", line 3, in build_genome_table
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/api.py", line 55, in __init__
_as_declarative(cls, classname, cls.__dict__)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 88, in _as_declarative
_MapperConfig.setup_mapping(cls, classname, dict_)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 103, in setup_mapping
cfg_cls(cls_, classname, dict_)
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 135, in __init__
self._early_mapping()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 138, in _early_mapping
self.map()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/ext/declarative/base.py", line 529, in map
**self.mapper_args
File "<string>", line 2, in mapper
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 623, in __init__
self._configure_inheritance()
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/orm/mapper.py", line 930, in _configure_inheritance
self.local_table)
File "<string>", line 2, in join_condition
File "/cluster/home/ifiddes/python2.7/lib/python2.7/site-packages/sqlalchemy/sql/selectable.py", line 839, in _join_condition
(a.description, b.description, hint))
sqlalchemy.exc.NoForeignKeysError: Can't find any foreign key relationships between 'AbstractGenome' and 'A'.
Как я могу идти о динамически генерировать Genome
таблицу на основе прошедшего имени ? Мне также идеально понравилась бы установка, в которой у меня может быть иерархическое наследование, чтобы я мог объявлять разные подклассы, например ReferenceGenome
или TargetGenome
, которые имеют дополнительные столбцы, но также могут иметь динамические имена.
SQLAlchemy пытается настроить наследование и сбой, поскольку у вас нет внешнего ключа между таблицей 'A' и' AbstractGenome'. Действительно ли вы намереваетесь создать как таблицу 'A', так и таблицу AbstractGenome? Если нет, вы должны поместить '__abstract__ = True' в определение' class Genome'. – univerio