Я начинаю изучать python, и у меня возникают проблемы с получением n вывода для печати в txt-файл на рабочем столе. Я хочу, чтобы это был Mac и Windows. Я продолжаю получать синтаксическую ошибку в строке, которая не существует, или нет такого каталога файлов в строке 4. Я пытаюсь создать текстовый файл.Выпуск записи в файл
import os
os.path.join("~","Desktop")
output_file = open(os.path.join("~","Desktop","PythoBLASTout.txt"),"w")
from Bio import SearchIO
E_VALUE_THRES = 0.01
with open('/Users/evanclark/conesnail.xml', 'rU') as input:
for qresult in SearchIO.parse(input, "blast-xml"):
hits = qresult.hits
query_id = qresult.id
if len(hits) > 0:
target_id = hits[0].id
evalue = hits[0].hsps[0].evalue
if evalue < E_VALUE_THRES:
print("%s\t%s" % (query_id, target_id))
#output_file.write("%s\t%s" % (query_id, target_id)
Пожалуйста, убедитесь, что все ваши импорта сделаны в начале вашей программы. –