Сценарий оболочки для создания каталогов

Question

Я пытаюсь создать простой сценарий оболочки для рекурсивного создания каталогов внутри списка каталогов.

У меня есть следующая файловая структура: Каталог с именем v_79, содержащий список «dirs» (от dir_0 до dir_210), и внутри каждого из них имеется несколько каталогов ENSG00000 ??????, где '?' обозначает символ между [0-9].

Я хотел бы создать каталог под названием «my_dir» внутри каждого из ENSG00000 ????? каталоги.

Я знаю, как создать каталог однажды, находясь внутри каждого из dir_XX «s,

for i in ENSG00000??????; do mkdir $i/my_dir; done 

, но я не знаю, как создать каталог, что мне нужно, в каталоге v_79.

Answer 1

, если текущий каталог содержит каталог «v_79», затем

for dir in v_79/dir_{0..210}/ENSG00000??????; do mkdir $dir/my_dir; done 

Интересно, если что может привести к ошибке «слишком длинный список аргументов», и в этом случае find - это путь.

Answer 2

mkdir -p v_79/dir{0,1}{1,2,3} 

создаст каталоги V79/dir01, V79/dir02, V79/dir03, V79/dir11, V79/dir12 и V79/dir13 даже если v_79 не существует.

Параметры -p будут реорганизовать все требуемые каталоги.

Answer 3

Если ток НАПРАВЛ v_79, вы можете использовать комбинацию find и xargs:

find . -name 'ENSG00000......' -type d | xargs -I DIR mkdir DIR/my_dir 

Answer 4

Вы можете сделать это из каталога v_79:

for i in `find . -type d -name "ENSG00000??????"`; do mkdir $i/my_dir; done 

Answer 5

Просто добавьте параметр -p, то ваша работа будет выполнена.

КСТАТИ: опция -p для команды MKDIR означает «нет ошибки, если существующие, сделать родительские каталоги по мере необходимости»

Answer 6

Вы хотите

mkdir v_79/dir_{0,1,2}{,0,1,2,3,4,5,6,7,8,9}{,0,1,2,3,4,5,6,7,8,9}/ENSG00000??????/my_dir 

Answer 7

это для dry run - удостоверившись, удалите эхо перед тем MKDIR

echo ./v_79/**/ENSG* | xargs -I% echo mkdir %/my_dir #or 
echo ./v_79/**/dir_*/ENSG* | xargs -I% echo mkdir %/my_dir 

вам нужно для этого bash4 и "shopt -s globstar" (например, в вашем профиле)

Если у вас слишком много каталогов, вы можете получить слишком длинную ошибку списка аргументов (для первого эха).В этом случае решение с find лучше

find v_79 -type d -print | grep '/ENSG' | xargs -I% echo mkdir %/my_dir 

• найти все каталоги в v_79
• отфильтровывать только они с именем ENSG (вы можете добавить больше «фильтры»)
• бег (эхо) MkDir результата

находится где-то в пути может быть пространство, модифицировать выше:

find v_79 -type d -print0 | grep -z '/ENSG' | xargs -0 -I% echo mkdir %/my_dir 

Кроме того, вы можете ограничить глубину команды поиска и т.д .:

find v_79 -depth 2 -type d -print0 | grep -z '/ENSG' | xargs -0 -I% echo mkdir %/my_dir 

снова, все выше для сухого хода - удалить эхо для бега. ;)