2015-11-09 2 views
1

Я пытаюсь найти метод выбора полезной функции на множестве из 20000 генов из набора выражений (microarray), чтобы получить модель только с полезными генами. Я попытался использовать RFE из каретки, но у меня была ошибка StackOverflow, так как обратный выбор не поддерживает данные, где n (предсказатели)> n (образцы). Может ли кто-нибудь предложить разумный метод для этого? Или решение для этого метода выбора RFE?Выбор функции

Заранее спасибо.

ответ

1

Вы пытались использовать генетические алгоритмы для выбора функции? Для этого есть разные пакеты - GA, genalg, caret (в R).

Посмотрите на этом блог, выбор функции с использованием генетических алгоритмов был объяснен с примером - http://topepo.github.io/caret/GA.html

Надеется, что это помогает.

Смежные вопросы