Временной цикл для поиска индексов матрицы, удовлетворяющих определенным условиям

Question

Первые два цикла для циклов обнаруживают индексы ненулевых элементов, а последние два определяют индексы элементов со значением 1 в разных массивах.

for s in [x for x in range(5000) if t_f_ext[0,x]!=0]: 
      for r in [x for x in range(400) if t_f_ext[x,s]!=0]: 
       J_syn=(-13.75-5.25*inh[s]) 
       tau_r=0.2*(2-inh[s]) 
       tau_d=2-inh[s] 
       I_ext[r,s]=J_syn*(tau_m[s]/(tau_d-tau_r))*(np.exp(-(i*delta_t-  tau_l-t_f_ext[r,s]+1)/tau_d)-np.exp(-(i*delta_t-tau_l-t_f_ext[r,s]+1)/tau_r)) 
     for p in [x for x in range(5000) if int_spike[x]==1]: 
      for q in [x for x in range(5000) if con[p,x]==1]: 
       k_int[q]+=1 
       t_f_int[np.mod((k_int[q]-1),400).astype(int),q]=i*delta_t 
       pr[np.mod((k_int[q]-1),400).astype(int),q]=p 

Answer 1

У меня нет данных, чтобы проверить с, но я хотел бы избежать этих конструкций:

[x for x in range(5000) if t_f_ext[0,x]!=0] 

Этот список понимание мог генерировать большой список.

Если вы используете генераторы вместо этого, вы можете избежать строительства списков: (. Обратите внимание на изменение в xrange а)

(x for x in xrange(5000) if t_f_ext[0,x] != 0) 

Поскольку вы в основном фильтрации, вы можете также использование ifilter из itertools. Например, это фильтрует четные числа от 0 до 100:

ifilter(lambda x: x % 2 == 0, xrange(101)) 

Другой вариант заключается в использовании этой альтернативной конструкции:

for s in xrange(5000) 
    if t_f_ext[0,x] == 0: 
     continue 
    for r in xrange(400): 
     if t_f_ext[x,s] == 0: 
      continue 
     [...] 

После того, как вы сделаете эти изменения, запустите его с cProfile чтобы увидеть, где ваш горячие точки.