Case $ 1 bash script

Question

Что мне нужно сделать, если мне нужно добавить 2 или более символов в кодон? Потому что кодон только обнаруживает мой первый вход в 1 доллар.

for arg; do 
     case "$1" in 
      -n) shift 
       codonnumber="$1" 
       ;; 
      -g) shift 
       codon="$1" 
       ;; 
      [a-z]*) file="$1";; 


     esac 
     shift 
    done 
    echo codonnumber="$codonnumber" codons="$codon" file="$file" 

Ex: Если я в "$ кодона": корень @ pc3-03: ~/Desktop # ./script.sh -n 4 -g AAA ТГК sequence.fasta

Это только обнаруживает ААА, NO ААА, а позже ТГК

Answer 1

следующая:

[a-z]*) file="$1";; 

соответствует последним два аргумента TGC и sequence.fasta. По существу, переменная file первоначально инициализируется до TCG, а затем до sequence.fasta.

Вы, наверное, хотел сказать:

./script.sh -n 4 -g "AAA TGC" sequence.fasta 

(. Обратите внимание на кавычки вокруг аргументы AAA, TGC)