2016-08-28 4 views
0

Очень новый пользователь здесь. Я пытаюсь использовать lsoda для решения дифференциальных уравнений, расслоенных на два слоя (как обозначается петлей for(s in 1:2)).Сообщение об ошибке с объектами в 'lsoda' в R

При выполнении этого полный код, я получаю сообщение об ошибке

объект «N» не найден

независимо от того, где и как я пытаюсь определить N.

Может ли кто-нибудь помочь выявить ошибку или сообщить о том, что я делаю неправильно? Заранее спасибо.

код R:

library(deSolve) 

Dyn <- function(t, var,par) { 

    with(as.list(c(par, var)), { 

    for(s in 1:2){ 

     #Derivatives 
     dX[s] <- mu*N[s] - sigma*X[s] - (c[s]*beta*(InD[s] +ID[s]+ IdT[s])/N[s])*X[s] - mu*X[s] 

     dXint[s] <- sigma*X[s] - (1-omega)*(c[s]*beta*(InD[s] +ID[s]+ IdT[s])/N[s])*Xint[s] - mu*Xprep[s] 

     dInD[s] <- (c[s]*beta*(InD[s] +ID[s]+ IdT[s])/N[s])*X[s] - psi*InD[s]- mu*InD[s] 

     dID[s] <- (1-omega)*(c[s]*beta*(InD[s] +ID[s]+ IdT[s]) /N[s])*Xint[s]+ psi*InD[s]- mu*ID[s] 

     N[s] <- X[s]+Xint[s]+InD[s]+ID[s] 

     diffs <- c(dX[s], dXint[s], dInD[s], dID[s], N[s])} 

    return(list(diffs)) 

    })} 

#Defining parameter and initial values 

par <- c(mu=0.033, sigma=0.29, beta=0.40, c=c(2, 30), Ctot=1773600, N=c(332550, 36950), psi=0.022, omega=0.44) 

init <- c(X=c(332550,36950), Xint=c(0,0), InD=c(1,1), ID=c(0,0)) 

t <- seq(0, 30, by=0.1) 

#Numerical solution# 

Hom.sol <- lsoda(init, t, Dyn,par) 
+0

Я не вижу, где вы определили '' N'', - дайте нам полный воспроизводимый пример , Для справки см. [Здесь] (http://stackoverflow.com/questions/5963269/how-to-make-a-great-r-reproducible-example) –

ответ

0

Я думаю, что вы путаете параметры и переменные. N, как представляется, определяется как параметр par с размером 2. Однако в определении вашей модели вы обновляете N с размером 1.

+0

Спасибо, что заметили это. Я исправил код (см. Выше), так что N теперь имеет 2 измерения также --- добавив N [s]. Я все равно получаю такое же сообщение об ошибке - «объект» N «не найден». N [s] - это общее количество всех остальных отсеков в этих слоях, как это определено сейчас. Любые мысли о том, что мне не хватает? Спасибо. – user6767735