Все, что на мой взгляд является количество элементов, которые вы пытаетесь вписаться в контейнер. Как пример, если вы удалите некоторые ссылки, у вас больше нет этой проблемы.
Таким образом, вы можете настроить, как видите.
<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/2.1.1/jquery.min.js"></script>
<script src="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.5/js/bootstrap.min.js"></script>
<link href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.5/css/bootstrap.min.css" rel="stylesheet" />
<h3>Fewer Links</h3>
<div class="navbar navbar-inverse">
<div class="container">
<div class="navbar-header">
<button type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target=".navbar-collapse"> <span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
</button> <a href="/poultry" class="navbar-brand">All Things Poultry</a>
<a href="#" class="dropdown-toggle navbar-brand" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false"><span class="caret"></span></a>
<ul class="dropdown-menu" role="menu">
<li class="text-center">AllThings Sites</li>
<li class="divider"></li>
<li><a href="/farming">AllThings Farming</a>
</li>
<li><a href="/livestock">AllThings Livestock</a>
</li>
<li><a href="/poultry">AllThings Poultry</a>
</li>
</ul>
</div>
<div class="navbar-collapse collapse">
<ul class="nav navbar-nav">
<li> <a href="/Poultry/geese">Geese</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/poultrysupplies">Supplies</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/turkeys">Turkeys</a>
</li>
</ul>
<ul class="nav navbar-nav navbar-right">
<li><a href="/poultry/register">Register</a>
</li>
<li><a href="/poultry/login">Log in</a>
</li>
<li>
<a data-toggle="modal" href="#selectLocation" class="pull-right">
<img alt="Select Country" height="20" src="http://placehold.it/150x50" />
</a>
</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
<hr>
<h3>Current Links</h3>
<div class="navbar navbar-inverse">
<div class="container">
<div class="navbar-header">
<button type="button" class="navbar-toggle" data-toggle="collapse" data-target=".navbar-collapse"> <span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
<span class="icon-bar"></span>
</button> <a href="/poultry" class="navbar-brand">All Things Poultry</a>
<a href="#" class="dropdown-toggle navbar-brand" data-toggle="dropdown" role="button" aria-expanded="false"><span class="caret"></span></a>
<ul class="dropdown-menu" role="menu">
<li class="text-center">AllThings Sites</li>
<li class="divider"></li>
<li><a href="/farming">AllThings Farming</a>
</li>
<li><a href="/livestock">AllThings Livestock</a>
</li>
<li><a href="/poultry">AllThings Poultry</a>
</li>
</ul>
</div>
<div class="navbar-collapse collapse">
<ul class="nav navbar-nav">
<li> <a href="/Poultry/chickens">Chickens</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/ducks">Ducks</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/poultryevents">Events</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/gamebirds">Game Birds</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/geese">Geese</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/poultrysupplies">Supplies</a>
</li>
<li> <a href="/Poultry/turkeys">Turkeys</a>
</li>
</ul>
<ul class="nav navbar-nav navbar-right">
<li><a href="/poultry/register">Register</a>
</li>
<li><a href="/poultry/login">Log in</a>
</li>
<li>
<a data-toggle="modal" href="#selectLocation" class="pull-right">
<img alt="Select Country" height="20" src="http://placehold.it/150x50" />
</a>
</li>
</ul>
</div>
</div>
</div>
Покажите нам, что вы пробовали до сих пор. Создайте минимальный пример в jsfiddle или bootply. – ZimSystem