2016-05-10 4 views
1

Когда-то давно я установил пакет conda в Dropbox, но затем Dropbox сделал меня грязным, поэтому я установил его в другой каталог. Удалил все и начал новый, но каким-то образом R вызывается из старого каталога.R Ядро в Jupyter использует неправильный каталог

Что вызывает неправильный каталог R, поэтому я могу войти и изменить его?

Мой текущий R является:

$ which R 
/Users/Mu/Sync/anaconda/bin/R 

Это моя ошибка, когда я пытаюсь запустить R ядро ​​

Traceback (most recent call last): 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/notebook/base/handlers.py", line 458, in wrapper 
    result = yield gen.maybe_future(method(self, *args, **kwargs)) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 1008, in run 
    value = future.result() 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/concurrent.py", line 232, in result 
    raise_exc_info(self._exc_info) 
    File "<string>", line 3, in raise_exc_info 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 1014, in run 
    yielded = self.gen.throw(*exc_info) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/sessions/handlers.py", line 58, in post 
    sm.create_session(path=path, kernel_name=kernel_name)) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 1008, in run 
    value = future.result() 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/concurrent.py", line 232, in result 
    raise_exc_info(self._exc_info) 
    File "<string>", line 3, in raise_exc_info 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 1014, in run 
    yielded = self.gen.throw(*exc_info) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/sessions/sessionmanager.py", line 73, in create_session 
    self.kernel_manager.start_kernel(path=kernel_path, kernel_name=kernel_name) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 1008, in run 
    value = future.result() 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/concurrent.py", line 232, in result 
    raise_exc_info(self._exc_info) 
    File "<string>", line 3, in raise_exc_info 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/tornado/gen.py", line 282, in wrapper 
    yielded = next(result) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/notebook/services/kernels/kernelmanager.py", line 87, in start_kernel 
    super(MappingKernelManager, self).start_kernel(**kwargs) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/jupyter_client/multikernelmanager.py", line 110, in start_kernel 
    km.start_kernel(**kwargs) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/jupyter_client/manager.py", line 243, in start_kernel 
    **kw) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/jupyter_client/manager.py", line 189, in _launch_kernel 
    return launch_kernel(kernel_cmd, **kw) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/jupyter_client/launcher.py", line 123, in launch_kernel 
    proc = Popen(cmd, **kwargs) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/subprocess.py", line 950, in __init__ 
    restore_signals, start_new_session) 
    File "/Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/subprocess.py", line 1544, in _execute_child 
    raise child_exception_type(errno_num, err_msg) 
FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: '/Users/Mu/Dropbox/anaconda/lib/R/bin/R' 
+0

говорит файл не найден для '/ Users/Mu/Dropbox/anaconda/lib/R/bin/R'. Где сюрприз в этом? Я бы подумал, что нам нужно будет знать _exactly_ «как» вы «пытались запустить ядро ​​R». Это странное место, где можно поставить R. Вам может потребоваться рассказать нам, как и какая версия использовалась при установке R. –

+0

Я знаю, что он ищет его в неправильном каталоге, но я не знаю, какой скрипт вызывает этот путь, поэтому я могу изменить его в нужный каталог. Я не говорю, что сюрприз заключается в том, что он не работает, неожиданность в том, что он использует неправильный каталог, и я не знаю, почему он туда направляется. –

+0

Что находится в «/ Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3. 5/subprocess.py "или" /Users/Mu/Sync/anaconda/lib/python3.5/site-packages/jupyter_client/launcher.py "? –

ответ

1

запустить R и использовать эту команду IRkernel::installspec()

+1

Спасибо за тонну за этот ответ! Я боролся с одной и той же проблемой, и это решило это в нерабочее время. –