Monaca полагается на Кордову, которая сама полагается на Npm. В Monaca можно использовать плагины Cordova, но я хотел бы знать, как использовать пакеты Npm в Monaca, для тех функций, для которых нет плагина Cordova.Npm пакеты в Monaca IDE?
Вы можете определенно использовать npm, если вы разрабатываете локально, а затем синхронизируйте свой проект с помощью Monaca IDE с помощью Monaca CLI/Localkit. Определенно, вы не можете использовать npm непосредственно из Monaca IDE (в основном по соображениям безопасности и производительности).
Для всех, кто приходит на этот вопрос, хочет добавить пакеты npm к приложению, работающему от Monaca, см. this question. Это помогает думать об этом не как добавление пакетов npm в Monaca, а в приложение Cordova.