Компиляция C совместно используемой библиотеки с setup.py distutils, когда библиотека зависит от второй общей библиотеки

Question

Я нахожусь в OSX, пытаясь скомпилировать общую библиотеку на C с setup.py distutils (для использования в python с использованием ctypes). Я новичок в distutils, но у меня возникают проблемы, когда разделяемая библиотека, которую я хочу скомпилировать (libreboundx.so), зависит от другой общей библиотеки (librebound.so). Явный, в modify_orbits_direct.c У меня есть

#include "rebound.h" 

rebound.h находится в каталоге/Users/дт/Отскок/ЦСИ /, и все функции rebound.h находятся в общей библиотеке librebound.so, которая in/Пользователи/dt/отскок /.

Ссылка на cc будет выглядеть.

cc -fPIC -shared reboundx.o -L/Users/dt/rebound -lrebound -o libreboundx.so 

UPDATE: Эта ситуация выглядит точно так же, как, например, в конце гл. 3 - https://docs.python.org/2/extending/building.html. Я обновил мой setup.py, чтобы имитировать, что один:

libreboundxmodule = Extension('libreboundx', 
       sources = [ 'src/reboundx.c', 
          'src/modify_orbits_direct.c'], 
       include_dirs = ['src', '/Users/dt/rebound/src'], 
       extra_compile_args=['-fstrict-aliasing', '-O3','-std=c99','-march=native', '-D_GNU_SOURCE', '-fPIC'], 
       library_dirs=['/Users/dt/rebound'], 
       libraries=['rebound'], 
           ) 

Это устанавливает штраф, когда я бегу

pip install -e ./ 

выход Сложение:

You are using pip version 7.0.3, however version 7.1.2 is available. 
You should consider upgrading via the 'pip install --upgrade pip' command. 
Obtaining file:///Users/dtamayo/Documents/workspace/reboundx 
Installing collected packages: reboundx 
Running setup.py develop for reboundx 
Successfully installed reboundx-1.0 

, но когда я пытаюсь

import reboundx 

в Python, я получаю OSError: dlopen (lib reboundx.so, 10): Символ не найден: _reb_boundary_particle_is_in_box, который является функцией в другой библиотеке (librebound.so), которая даже не вызывается в коде для libreboundx.so.

Если я связываю общую библиотеку с приведенной выше командой cc, все работает, и я могу использовать общую библиотеку libreboundx.so отлично в C. Если я попытаюсь взять тот же libreboundx.so, я скомпилирую команду cc и придерживаться его, где setup.py бы поставить его, а затем попытаться импортировать reboundx в Python, я вместо того, чтобы получить

OSError: dlopen(/Users/dtamayo/Documents/workspace/reboundx/reboundx/../libreboundx.so, 10): Library not loaded: librebound.so 

Реферировано от: /Users/dtamayo/Documents/workspace/reboundx/libreboundx.so Причина: изображение не найден

Может ли это быть проблемой rpath, где во время выполнения libreboundx.so не знает, где искать l ibrebound.so?

Answer 1

Спасибо за все предложения. Я должен был указать в вопросе, что в конце концов я хочу решение, которое я мог бы упаковать для загрузки в PyPy, чтобы пользователи могли установить одну команду. Он также должен работать как на OSX, так и на Linux, поэтому я предпочел решения, не связанные с install_name_tool.

Я не был в состоянии проверить это, но я думаю, что добавление

runtime_library_dirs=['/Users/dt/rebound'], 

рядом с library_dirs должны решить эту проблему на Linux. По-видимому, это не работает на Mac, но вместо этого вы можете использовать extra_link_args. Добавление этого ниже определения libreboundxmodule, вышеописанного,

исправлено решение проблемы.Я нашел ответ здесь: Python runtime_library_dirs doesn't work on Mac