ggplot2 - использование двух разных цветовых шкал для наложенных графиков

Question

Я пытаюсь наложить два разных графика. Один - geom_boxplot, другой geom_jitter. Я бы хотел, чтобы у каждого была своя цветовая гамма. Но когда я добавляю вторую цветовую шкалу, мне дается ошибка

"Scale for 'fill' is already present. Adding another scale for 'fill', 
    which will replace the existing scale." 

Я предполагаю, что я делаю что-то неправильно. Любой совет будет оценить

Это грубый пример моего рабочего кода:

P <- ggplot(dat) + 
      geom_boxplot(aes(x=ve, y=metValue, fill=metric), alpha=.35, w=0.6, notch=FALSE, na.rm = TRUE) + 
      scale_fill_manual(values=cpalette1) + 
      geom_hline(yintercept=0, colour="#DD4466", linetype = "longdash") + 
      theme(legend.position="none") 

P + geom_jitter(dat2, aes(x=ve, y=metValue, fill=atd), 
       size=2, shape=4, alpha = 0.4, 
       position = position_jitter(width = .03, height=0.03), na.rm = TRUE) + 
       scale_fill_manual(values=cpalette2) 

dat и dat2 имеют ту же схему, но разные значения.

Я нашел несколько примеров, касающихся наложения графиков, но ни один из них, как представляется, не затрагивал эту проблему.

Answer 1

Сначала создайте два образца данных с такими же именами, как в примере.

dat<-data.frame(ve=rep(c("FF","GG"),times=50), 
       metValue=rnorm(100),metric=rep(c("A","B","D","C"),each=25), 
       atd=rep(c("HH","GG"),times=50)) 
dat2<-data.frame(ve=rep(c("FF","GG"),times=50), 
       metValue=rnorm(100),metric=rep(c("A","B","D","C"),each=25), 
       atd=rep(c("HH","GG"),times=50)) 

Я предполагаю, что вы не должны использовать аргумент fill= в geom_jitter(), потому что цвет shape=4 может быть установлен также с colour= аргументом. Затем вы можете использовать scale_colour_manual(), чтобы установить свои значения. Вместо cpallete просто используются названия цветов.

P <- ggplot(dat) + 
    geom_boxplot(aes(x=ve, y=metValue, fill=metric), alpha=.35, w=0.6, notch=FALSE, na.rm = TRUE) + 
    geom_hline(yintercept=0, colour="#DD4466", linetype = "longdash") + 
    scale_fill_manual(values=c("red","blue","green","yellow"))+ 
    theme(legend.position="none") 

P + geom_jitter(data=dat2, aes(x=ve, y=metValue, colour=atd), 
       size=2, shape=4, alpha = 0.4, 
       position = position_jitter(width = .03, height=0.03), na.rm = TRUE) + 
       scale_colour_manual(values=c("red","blue"))