HDF5 write thread concurrency

Question

Является ли HDF5 способным обрабатывать несколько потоков самостоятельно или же он должен быть синхронизирован извне? Пример OpenMP предлагает последний.

Если первое, то каков правильный способ определения данных для записи?

Answer 1

Anycorn,

HDF5 может обрабатывать несколько потоков без внешней синхронизации, хотя запись еще будет последовательной. Вы должны скомпилировать последнюю версию (1.8.6 от 4/5/2011) и запустить ./configure с флагами --enable-threadsafe и -with-pthreads=/pthreads-include-path/,/pthreads-lib-path/.

Например:

./configure --enable-threadsafe -with-pthreads=/usr/include,/usr/lib 

Что касается определения DataSpace для записи, самый простой способ состоит в построении основной прямоугольную гиперплоскости с использованием многомерного массива, значения ранга и функций H5Screate_simple. Шахта обычно выполняет те же шаги:

//NUM = Number of spaces in this dimension 
    //Create a 1 dimensional array 
    hsize_t dsDim[1] = {NUM}; 
    //Create the 1x1xNUM data space (rank param = 1). 
    hid_t dSpace = H5Screate_simple(1, dsDim, NULL); 
    ... 
    Create datasets using the dataspace 
    ... 
    //Release the data space 
    H5Sclose(dSpace); 

Надеюсь, это поможет!